在很久以前的一個村莊里，有一個婦人，非常希望有一個小寶寶。
於是她就去請求魔法師，魔法師就送給她一粒種子，並且對她說：
“把它種到土裡吧，就能達成你的願望。”婦人才剛把種子種下，這個神奇的種子，馬上就開出了一個鬱金香的花苞。
“哇！好漂亮的花苞！”
婦人情不自禁的吻了一下花苞，花苞就自己打開了，而且裡面還有一個又小又可愛的女娃娃。
小女孩長得十分可愛，但是只有拇指般的大小，因此就取名為“拇指仙童”吧！
白天，她以桌上的盤子作池塘，用花瓣當小船來遊玩。
到了晚上，拇指仙童就舒舒服服地睡在胡桃做的搖籃里，作着甜蜜的夢。
有一天晚上一隻蟾蜍潛進了婦人的房間，它一見到拇指仙童就十分喜歡，心想：“讓我把她帶回去，嫁給我兒子吧！”
於是，蟾蜍就把胡桃搖籃和拇指仙童，偷偷地帶回家了。
到了早上，拇指仙童醒了過來，發現自己睡在蓮葉上時，嚇了一大跳。
而且，她一聽說要嫁給蟾蜍時，更是嚇得傷心的哭了起來。
“好可憐喔！我們來幫助她吧！”小魚兒知道了拇指仙童的遭遇后，都十分的同情她。
他們合力咬斷了蓮花葉，蓮花葉慢慢地漂流開了，拇指仙童感激地說：“謝謝你們！”
拇指仙童在河上漂來漂去。
這時候，遇到了蝴蝶姑娘，蝴蝶姑娘十分熱心的說：“我也來幫忙吧！”
於是，它用帶子把拇指仙童乘坐的蓮花葉，拉到了岸邊。
突然，飛來了一隻金龜子，把拇指仙童抓走了。
拇指仙童好不容易從蟾蜍那兒逃走，卻又被金龜子捉走了。
金龜子將她帶到森林裡的一棵大樹上，並且神氣地對同伴說：“我撿到了一個可愛的小女孩！”
但是，金龜的夥伴們卻說：“哎呀！他只有二隻腳！”“而且她沒有鬍子，真是難看極了！”
所以，金龜子們都很討厭她，丟下了拇指仙童，就都跑掉了。
拇指仙童被丟棄在森林裡，她吃花蜜，睡花葉，喝露水，孤單的過日子。
不久，冬天來臨來了，天空飄着雪，花草也都枯萎了，拇指仙童沒有食物可吃，只有以枯葉裹身，但是仍然寒風刺骨。
拇指仙童又餓又冷地在森林中徘徊，心想：“啊！好冷喔，肚子又餓，這樣子下去，非餓死不可！”
拇指仙童一面打哆嗦，一面在雪中前進；終於，她發現了一間野鼠婆婆住的房子。
野鼠婆婆看見拇指仙童，十分同情的說：“好可憐啊！快進來吃點東西！”
於是，拇指仙童就在野鼠婆婆的家住了下來，每天幫野鼠婆婆做許多家事，過着快樂的日子。
有一天，拇指仙童發現了一隻生病的燕子。
拇指仙童就用枯草編成毯子，而且塞入棉花，來為生病的燕子取暖，還用花瓣收集露
水，來給燕子喝。
“可憐的燕子啊！你要早日康復唷！”一整個冬天，拇指仙童都無微不至的在照顧生病的燕子，希望他早日康復。
不久，春天來臨了。
燕子也在拇指仙童仔細的照顧下，很快地康復了。
“謝謝你！拇指仙童，我要回到綠色森林去了，再見！”
野鼠婆婆的隔壁，住着一隻有錢的鼴鼠，他很喜歡拇指仙童，要娶她做新娘，野鼠婆婆也贊成的說：“鼴鼠先生很有錢，你真是幸運啊！”
但是拇指仙童真的不想嫁給鼴鼠，她想；生活在土地里，看不到陽光，也看不到花朵；那是多麼單調的世界啊！
於是，她十分悲傷的哭泣着。
結婚的日子終於來臨了，拇指仙童站在野鼠婆婆的門口向太陽告別：“親愛的太陽公公，再見了。”
他十分悲傷的哭着，引來了那隻曾經被救的燕子，燕子說：“走吧！和我一起走吧！我可以帶你到一個很快樂、很美好的地方去！”
“謝謝、謝謝你來接我。”於是拇指仙童坐上燕子的背部，飛向一個溫暖之國。
溫暖的國度里，開滿了美麗的花；燕子將拇指仙童放在一朵最美麗的花上面，在那裡站着一位小小的花王子，花王子十分喜歡拇指仙童，並且向她求婚：“拇指仙童，請你嫁給我吧！”
“嗯……”拇指仙童也害羞地點頭答應了；於是，花仙子們都很高興，送給她一對翅膀，作為禮物。
從此，拇指仙童也能在花間飛來飛去，和王子過着快樂的日子。